RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UMPSP11172 480 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLYATQ6IB77 296 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STARD8Q92502 1023 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.52■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2AG2A6NM03 316 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SGTAO43765 313 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAMEF1O95521 474 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BROXQ5VW32 411 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAOXQ6QHF9 649 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYRK3O43781 588 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEC1O60732 1142 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCQ05315 142 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGUOKQ16854 277 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC28A1O00337 649 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENPP3O14638 875 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K13O43283 966 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACSL4O60488 711 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFN2O95140 757 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIGRP01833 764 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FTH1P02794 183 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD84Q9UIB8 345 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNAP91O60641 907 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCF3P15923 654 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNPDA1P46926 289 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLUD2P49448 558 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STYXQ8WUJ0 223 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP7Q93009 1102 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB23Q9ULC3 237 aa16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK16O75716 305 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4F21O95013 312 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NR2F1P10589 423 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC1A2P43004 574 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENPEPQ07075 957 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MACC1Q6ZN28 852 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD46Q86W74 232 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAX3P23760 479 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPS8Q12929 822 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9A7Q96T83 725 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KPNA5O15131 536 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGRN1O60291 552 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN19P0C672 248 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP3A5P20815 502 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WASP42768 502 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPX6P59796 221 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASSF1Q9NS23 344 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBNO60934 754 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.5■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms