RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MED28Q9H204 178 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MTRRQ9UBK8 725 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 POLLQ9UGP5 575 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CLPXO76031 633 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RECQL4O94761 1208 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SOX30O94993 753 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CDH1P12830 882 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PRG2P13727 222 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MNDAP41218 407 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC15A1P46059 708 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 GK3PQ14409 553 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ACOX1Q15067 660 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CCL15Q16663 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-205ENST00000480058 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 AGAP2Q99490 1192 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 S100A13Q99584 98 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TRIM2Q9C040 744 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-205ENST00000480058 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 A0A1W2PRG6 482 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KCNQ2O43526 872 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 OR10H3O60404 316 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RHAGQ02094 409 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TAMM41Q96BW9 452 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.439e-9■■□□□ 12.1
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PRPF4B-205ENST00000480058 OXSMQ9NWU1 459 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM159BA6NKW6 160 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 H0YGN5 161 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 USP12O75317 370 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ARL6IP5O75915 188 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 AKR1A1P14550 325 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-205ENST00000480058 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 USP4Q13107 963 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 BIKQ13323 160 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-205ENST00000480058 STARD3Q14849 445 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CHSY3Q70JA7 882 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TMC8Q8IU68 726 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-205ENST00000480058 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 C1orf109Q9NX04 203 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SNX7Q9UNH6 387 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NFS1Q9Y697 457 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 E7ESA3 106 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CASKO14936 926 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MSCO60682 206 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HPRP00739 348 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 GSTT2BP0CG30 244 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 GNAZP19086 355 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PRPS1L1P21108 318 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SCNN1GP51170 649 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ALDH3A2P51648 485 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ATP12AP54707 1039 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TPTEP56180 551 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CBLBQ13191 982 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NPY5RQ15761 445 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 IFI44LQ53G44 452 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 LPCAT4Q643R3 524 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KRT77Q7Z794 578 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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