RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 LRRC72A6NJI9 287 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM72CH0Y354 149 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PSMD3O43242 534 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CLDN11O75508 207 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DCTN3O75935 186 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CTSLP07711 333 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 APRTP07741 180 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SRCP12931 536 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CREB1P16220 341 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KRT4P19013 534 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TAC1P20366 129 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 C5AR1P21730 350 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SCTRP47872 440 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PLK1P53350 603 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CDH4P55283 916 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CLDN6P56747 220 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 C21orf59P57076 290 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZBTB16Q05516 673 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC18A2Q05940 514 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SULT2A1Q06520 285 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC12A1Q13621 1099 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PARP6Q2NL67 630 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ARTNQ5T4W7 220 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 USP30Q70CQ3 517 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM72BQ86X60 149 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCDC185Q8N715 623 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BANPQ8N9N5 519 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GDAP1Q8TB36 358 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ARRDC3Q96B67 414 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 APOPT1Q96IL0 206 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SERAC1Q96JX3 654 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FZD3Q9NPG1 666 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DTLQ9NZJ0 730 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.28□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KNTC1P50748 2209 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PPC4 97 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 DRGXA6NNA5 263 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ATP9BO43861 1147 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 CBFA2T3O75081 653 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 SPAG7O75391 227 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 PROS1P07225 676 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 AMPD1P23109 780 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 CD38P28907 300 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 OR1E1P30953 314 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 GKP32189 559 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ADRA1BP35368 520 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ACVRL1P37023 503 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 CTSKP43235 329 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 GRIA4P48058 902 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 RP1P56715 2156 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 TPI1P60174 286 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 GBE1Q04446 702 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 BNIP3Q12983 259 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ACACAQ13085 2346 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 SLC14A1Q13336 389 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 MPP2Q14168 576 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 C5orf22Q49AR2 442 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ARMC3Q5W041 872 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 STEAP4Q687X5 459 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.27□□□□□ -1.41
MITF-215ENST00000478490 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.27□□□□□ -1.41
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