RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-208ENST00000477447 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ACOT8O14734 319 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 OGG1O15527 345 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 HS6ST1O60243 411 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 TPPPO94811 219 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 OR2C1O95371 312 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ICAM1P05362 532 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 S1PR1P21453 382 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CAMPP49913 170 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 NLRP5P59047 1200 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SLC20A2Q08357 652 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 GRIK2Q13002 908 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 COASYQ13057 564 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 MEA1Q16626 185 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 WDR78Q5VTH9 848 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 JADE1Q6IE81 842 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SZRD1Q7Z422 152 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CCDC190Q86UF4 302 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 GPR180Q86V85 440 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SFR1Q86XK3 245 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF34Q8IZ26 560 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 TAAR8Q969N4 342 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PGAM5Q96HS1 289 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 IGSF21Q96ID5 467 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 EGLN2Q96KS0 407 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SMC6Q96SB8 1091 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 GAD1Q99259 594 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 GHITMQ9H3K2 345 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 OGFRQ9NZT2 677 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 FBXL17Q9UF56 701 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 VPS28Q9UK41 221 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PADI1Q9ULC6 663 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.29□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PRSS47A8MTI9 375 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 MAP2K7O14733 419 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 IKBKBO14920 756 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 GPC4O75487 556 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 DAB1O75553 588 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CCKBRP32239 447 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 HOXD13P35453 343 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PSMB10P40306 273 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 FASLGP48023 281 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SNX16P57768 344 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 PDE1BQ01064 536 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CREB5Q02930 508 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SREBF2Q12772 1141 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 ZBTB17Q13105 803 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 DECR1Q16698 335 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 CCDC96Q2M329 555 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 TMEM198Q66K66 360 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 NRROSQ86YC3 692 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 LMO3Q8TAP4 145 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 HM13Q8TCT9 377 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 FIG4Q92562 907 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 QRFPRQ96P65 431 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 IL17FQ96PD4 163 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 OR2A14Q96R47 310 aa3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TARDBP-208ENST00000477447 SIL1Q9H173 461 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms