RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	PCYT2	Q99447	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PLCH2	O75038	1416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	BMPR1B	O00238	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	CD4	P01730	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	SPARC	P09486	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ITGA2	P17301	1181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	AMD1	P17707	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	USP8	P40818	1118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF132	P52740	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	FANCA	O15360	1455 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFU1-209	ENST00000474230	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	SPINT2	O43291	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CDH1	P12830	882 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	MYOD1	P15172	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	MT3	P25713	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	TAS2R38	P59533	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	FOXM1	Q08050	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	DECR1	Q16698	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230		Q6ZTC4	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	MLYCD	O95822	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	UMOD	P07911	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	UBA7	P41226	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	APBB2	Q92870	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CD101	Q93033	1021 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	KRT86	O43790	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	MBD4	O95243	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	CLCN3	P51790	818 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	PDE1B	Q01064	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	GRIK2	Q13002	908 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1-209	ENST00000474230	KRT81	Q14533	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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