RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 TROAPQ12815 778 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 DECR1Q16698 335 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SMIM29Q86T20 159 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 PDILTQ8N807 584 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 PIGTQ969N2 578 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 TAAR8Q969N4 342 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 QRFPRQ96P65 431 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 KLHL1Q9NR64 748 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 EHD2Q9NZN4 543 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 C16orf97H3BN30 126 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 USP8P40818 1118 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 CLDN20P56880 219 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SYT16Q17RD7 645 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 C18orf63Q68DL7 685 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 TRNP1Q6NT89 227 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 USP43Q70EL4 1123 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 GPR180Q86V85 440 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SMC6Q96SB8 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 ASPDHA6ND91 283 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 UMODP07911 640 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 CETPP11597 493 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 CHMP24386 653 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 UBA7P41226 1012 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 FASLGP48023 281 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 STPG1Q5TH74 334 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 C1orf74Q96LT6 269 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 EPYCQ99645 322 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 SYT17Q9BSW7 474 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 KRT84Q9NSB2 600 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-210ENST00000472326 LIPT2A6NK58 231 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 HS3ST1O14792 307 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD28O15084 1053 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GRID2O43424 1007 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 NDUFS3O75489 264 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 IGKV3-20P01619 116 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CRYAAP02489 173 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 RARGP13631 454 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PIK3CAP42336 1068 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GALCP54803 685 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 COG7P83436 770 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GTF2H2Q13888 395 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 NAB2Q15742 525 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF329Q86UD4 541 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ADSSL1Q8N142 457 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ITPAQ9BY32 194 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 STK39Q9UEW8 545 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ICAM1P05362 532 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PRCPP42785 496 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 FMO5P49326 533 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 AMPHP49418 695 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF234Q14588 700 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 HM13Q8TCT9 377 aa6.57□□□□□ -1.36
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