RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 PLTPP55058 493 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PRAMEP78395 509 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 WASHC5Q12768 1159 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 OVGP1Q12889 678 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZBTB17Q13105 803 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLMAPQ14BN4 828 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 HIF1AQ16665 826 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 UGP2Q16851 508 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ARMC3Q5W041 872 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 IQCHQ86VS3 1027 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 OXR1Q8N573 874 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GDAP1Q8TB36 358 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MDM1Q8TC05 714 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CDKL2Q92772 493 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 VOPP1Q96AW1 172 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RTP4Q96DX8 246 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 BMFQ96LC9 184 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LHX3Q9UBR4 397 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 APPL1Q9UKG1 709 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SNX24Q9Y343 169 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 IGLON5A6NGN9 336 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CFAP99D6REC4 459 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FPGTO14772 594 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RAD51CO43502 376 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 AP1G1O43747 822 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RFPL3O75679 317 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TM7SF2O76062 418 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PGLSO95336 258 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ETS1P14921 441 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TPSB2P20231 275 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 HTR1BP28222 390 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 IGFALSP35858 605 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RGRP47804 291 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SKOR1P84550 965 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC7A5Q01650 507 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SEMA5AQ13591 1074 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GTF2H3Q13889 308 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TPSAB1Q15661 275 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC1A5Q15758 541 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 BBS9Q3SYG4 887 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCID2Q5JVF3 399 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LGSNQ5TDP6 509 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FAXCQ5TGI0 409 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 Q6ZSR6 202 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MCUQ8NE86 351 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CALML6Q8TD86 181 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC39Q96DD0 335 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SCRN2Q96FV2 425 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms