RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PRELID2	Q8N945	189 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GLMN	Q92990	594 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	IL17C	Q9P0M4	197 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GULP1	Q9UBP9	304 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	BPTF	Q12830	3046 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZNF185	O15231	689 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TRIM16	O95361	564 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GAS8	O95995	478 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FUCA1	P04066	466 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SPAM1	P38567	509 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SEPT6	Q14141	434 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	LINC00523	Q86TU6	105 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GDAP1	Q8TB36	358 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	COX14	Q96I36	57 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GPR34	Q9UPC5	381 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		17.61	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PTPRB	P23467	1997 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	RP1	P56715	2156 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CPED1	A4D0V7	1026 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PPFIA2	O75334	1257 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	RFPL3	O75679	317 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	IVL	P07476	585 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	APRT	P07741	180 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SPINK2	P20155	84 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	RPIA	P49247	311 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS15	P98073	1019 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PDE1B	Q01064	536 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	POU6F1	Q14863	301 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	NR0B2	Q15466	257 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ST3GAL2	Q16842	350 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	C4orf22	Q6V702	233 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GLYATL1	Q969I3	302 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	IL26	Q9NPH9	171 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	KCTD3	Q9Y597	815 aa		17.6	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	KNTC1	P50748	2209 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CTAGE9	A4FU28	777 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CKMT1A	P12532	417 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ADCY8	P40145	1251 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ACADVL	P49748	655 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	VPS41	P49754	854 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TERF1	P54274	439 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CHRNA6	Q15825	494 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DHRS13	Q6UX07	377 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		17.59	■□□□□ 0.41

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