RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445180.2

LINC01648-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1648, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01648, Length 1,519 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01648-201ENST00000445180 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 UGT1A3P35503 534 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 UGT1A5P35504 534 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 IFT88Q13099 833 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ITGA9Q13797 1035 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ARHGEF7Q14155 803 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PIM3Q86V86 326 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 HCN2Q9UL51 889 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 A0A1W2PPC1 479 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 TK2O00142 265 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ITM2AO43736 263 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 DLX3O60479 287 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 VPS26AO75436 327 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CA5AP35218 305 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 SLC1A6P48664 564 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 RGS19P49795 217 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 OVGP1Q12889 678 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 HTR4Q13639 388 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 DPPA4Q7L190 304 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ISCA2Q86U28 154 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 RBFAQ8N0V3 343 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 KCNJ9Q92806 393 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 RAD18Q9NS91 495 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 XPR1Q9UBH6 696 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CD207Q9UJ71 328 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 SARDHQ9UL12 918 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 TMEM114B3SHH9 223 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 GPR39O43194 453 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CD1DP15813 335 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 IGFBP4P22692 258 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ACRV1P26436 265 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 IL12RB1P42701 662 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 TNFRSF4P43489 277 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 GALK1P51570 392 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PFKPQ01813 784 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 ASPHQ12797 758 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 E2F5Q15329 346 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 LIPMQ5VYY2 423 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 NXPE1Q8N323 547 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 C10orf82Q8WW14 230 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 GPR21Q99679 349 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CDH19Q9H159 772 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 FAM50BQ9Y247 325 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC01648-201ENST00000445180 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 H3BMM5 538 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 TFEBP19484 476 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 ITGB7P26010 798 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 DCDC1P59894 354 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 DNAJB13P59910 316 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 RALGDSQ12967 914 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 ENPP2Q13822 863 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 ERAP2Q6P179 960 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 ARRDC3Q96B67 414 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 ULK4Q96C45 1275 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 DERL2Q9GZP9 239 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC01648-201ENST00000445180 CLPBQ9H078 707 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms