RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SGK2Q9HBY8 427 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ASLP04424 464 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 KIR3DL1P43629 444 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GNPDA1P46926 289 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ANKFN1Q8N957 763 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OR2T12Q8NG77 320 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 BAP1Q92560 729 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TMCO6Q96DC7 493 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZNF639Q9UID6 485 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 VWA7Q9Y334 891 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FAM172BPA6NC97 362 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 BCKDKO14874 412 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 SLITRK3O94933 977 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IGFBP5P24593 272 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 S100A2P29034 98 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CMPK1P30085 196 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GXYLT1Q4G148 440 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 KLHL22Q53GT1 634 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ANO7Q6IWH7 933 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 PARGQ86W56 976 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DENND1CQ8IV53 801 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GAD1Q99259 594 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 OR6C75A6NL08 312 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 HCN1O60741 890 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CCNKO75909 580 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MATN4O95460 622 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FAM153BP0C7A2 387 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FAM35AQ86V20 835 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PIGXQ8TBF5 258 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC38A4Q969I6 547 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF347Q96SE7 839 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CAPN14A8MX76 684 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RGL2O15211 777 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SYVN1Q86TM6 617 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 A8MX80 341 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FPGTO14772 594 aa6.64□□□□□ -1.35
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