RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 DHRS12A0PJE2 317 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SDHDO14521 159 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 NUAK1O60285 661 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 POLBP06746 335 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 OR4Q2P0C623 313 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 ELMOD1Q8N336 334 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 MYLPFQ96A32 169 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 KLQ9UEF7 1012 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 EI24O14681 340 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 TBC1D4O60343 1298 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 PLCL1Q15111 1095 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 DLG2Q15700 870 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 USP43Q70EL4 1123 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 KDM1BQ8NB78 822 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF558Q96NG5 402 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SLC9A7Q96T83 725 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM15Q9C019 465 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CENPBD1B2RD01 187 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MRASO14807 208 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ABCB7O75027 752 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PLA2G16P53816 162 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BCAT1P54687 386 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SQLEQ14534 574 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AGKQ53H12 422 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AKAP14Q86UN6 197 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FAM35AQ86V20 835 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GOLM1Q8NBJ4 401 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FKBP10Q96AY3 582 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DUSP16Q9BY84 665 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MTRRQ9UBK8 725 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ILVBLA1L0T0 632 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LCHNA4D1U4 455 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NCAM1P13591 858 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PDGFRAP16234 1089 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LAG3P18627 525 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RGS7P49802 495 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC7A2P52569 658 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AQP6Q13520 282 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DDIASQ8IXT1 998 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TXNDC15Q96J42 360 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SYBUQ9NX95 663 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 VWA7Q9Y334 891 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TK2O00142 265 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HDCP19113 662 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CDO1Q16878 200 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CES3Q6UWW8 571 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SMOQ99835 787 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TTPALQ9BTX7 342 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TASP1Q9H6P5 420 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms