RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 IFNEQ86WN2 208 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 DSEQ9UL01 958 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MYADML2A6NDP7 307 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ABCB7O75027 752 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PMPCBO75439 489 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NCK1P16333 377 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 LBPP18428 481 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC26A3P40879 764 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MLLT10P55197 1068 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CDH13P55290 713 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RPS6KA2Q15349 733 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ISCA2Q86U28 154 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MAGED4Q96JG8 741 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MUS81Q96NY9 551 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 BDH2Q9BUT1 245 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 LHPPQ9H008 270 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 AZIN1O14977 448 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 B4GAT1O43505 415 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CDK14O94921 469 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SCNN1GP51170 649 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 LIPEQ05469 1076 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NFYCQ13952 458 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GPR158Q5T848 1215 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RANBP10Q6VN20 620 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TSPEARQ8WU66 669 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF347Q96SE7 839 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 H0Y858 1186 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 M0QZ92 97 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GABRDO14764 452 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 THP07101 528 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MTA1Q13330 715 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 BFSP2Q13515 415 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GEN1Q17RS7 908 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RABL3Q5HYI8 236 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HASPINQ8TF76 798 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TAMM41Q96BW9 452 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CSF3RQ99062 836 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ING2Q9H160 280 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TLR9Q9NR96 1032 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.87□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PP18 115 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HGFP14210 728 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 OXA1LQ15070 435 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KANK2Q63ZY3 851 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT7Q86SF2 657 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RNF34Q969K3 372 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GIN1Q9NXP7 522 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CPQQ9Y646 472 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 BPTFQ12830 3046 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KRBA1A5PL33 1030 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MATN3O15232 486 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KCNH1O95259 989 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 BDNFP23560 247 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GSTM2P28161 218 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SHMT2P34897 504 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 APLP1P51693 650 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GNASQ5JWF2 1037 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.86□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MROQ9BYG7 248 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms