RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD7Q92527 254 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF778Q96MU6 729 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ADI1Q9BV57 179 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 BBS2Q9BXC9 721 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM9Q9C026 710 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SGK2Q9HBY8 427 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 DONSONQ9NYP3 566 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM131Q92545 1883 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WWV3 80 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC169A6NNP5 214 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PRRT4C9JH25 899 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 PEX1O43933 1283 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEC1O60732 1142 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LYPLA2O95372 231 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DNTTP04053 509 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GP1BAP07359 652 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ITGA2BP08514 1039 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ELFN1P0C7U0 828 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LIPCP11150 499 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2F1P24903 491 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 RXRGP48443 463 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 MAPK10P53779 464 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MLLT10P55197 1068 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TUBB4BP68371 445 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KLRB1Q12918 225 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TGIF1Q15583 401 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 FITM2Q8N6M3 262 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TEX19Q8NA77 164 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 ITPR2Q14571 2701 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPC4 97 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 TRIM38O00635 465 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TEX33O43247 280 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 TYRP14679 529 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A2P31639 672 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SYKP43405 635 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GPR3P46089 330 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 UQCRFS1P47985 274 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 VWA1Q6PCB0 445 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DPF1Q92782 380 aa6.38□□□□□ -1.39
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