RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STIP1P31948 543 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HMGCLP35914 325 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACTR1BP42025 376 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHRNA4P43681 627 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLDN6P56747 220 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACTR1AP61163 376 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDE1BQ01064 536 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTBSQ01459 385 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRP8Q14114 963 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PARP6Q2NL67 630 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 P3H1Q32P28 736 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C14orf28Q4W4Y0 310 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCTD16Q68DU8 428 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MARCH9Q86YJ5 346 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR26Q8NDV2 337 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCL4L1Q8NHW4 92 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NXPE2Q96DL1 559 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC25Q96NG3 672 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM121Q9BTD3 319 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CARD9Q9H257 536 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM39Q9HCM9 518 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAAR2Q9P1P5 351 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF148Q9UQR1 794 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 U3KQA8 63 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYLKQ15746 1914 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RP1P56715 2156 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RHPN2P1A8MT19 583 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FADS2P1A8MWK0 482 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR89AB7ZAQ6 455 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AURKAO14965 403 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZSCAN12O43309 604 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRTAMO95727 393 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR89BP0CG08 455 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLB1P16278 677 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BPIP17213 487 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AK4P27144 223 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPAM1P38567 509 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LMAN1P49257 510 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ITGA9Q13797 1035 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GTF2H3Q13889 308 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPIDRQ14159 915 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PYCR3Q53H96 274 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OGFOD3Q6PK18 319 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR156Q8NFN8 814 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLYATL1Q969I3 302 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EID2BQ96D98 161 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR24Q96S15 920 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBL1YQ9BQ87 522 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APOL2Q9BQE5 337 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2AG1Q9H205 316 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRIT1Q9P2V4 623 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKAP13Q12802 2813 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 E7EVH7 732 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRID2O43424 1007 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VEGFDO43915 354 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CSO75390 466 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCEA3O75764 348 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAS8O95995 478 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFNB1P01574 187 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FUCA1P04066 466 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC2A4P14672 509 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LPOP22079 712 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP4F3Q08477 520 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNX1Q13596 522 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PERM1Q5SV97 790 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RANBP10Q6VN20 620 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC89Q8N998 374 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC35B2Q8TB61 432 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BRSK1Q8TDC3 778 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATG4AQ8WYN0 398 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRAMD1AQ96CP6 724 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NRSN2Q9GZP1 204 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms