RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CNGA4Q8IV77 575 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TADA1Q96BN2 335 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 INTUQ9ULD6 942 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TFR2Q9UP52 801 aa22.32■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ATMQ13315 3056 aa22.32■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 TK2O00142 265 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 PRAMEF10O60809 474 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SLC1A1P43005 524 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CFHR1Q03591 330 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ADCY2Q08462 1091 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 PCSK7Q16549 785 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 RCBTB1Q8NDN9 531 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 FOXJ2Q9P0K8 574 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.31■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 K7ENP7 123 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 CSF2RBP32927 897 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CDKN2BP42772 138 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 GPR3P46089 330 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 MAPK10P53779 464 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TAZQ16635 292 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TC2NQ8N9U0 490 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 GPR26Q8NDV2 337 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 USP7Q93009 1102 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CMKLR1Q99788 373 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 WDR70Q9NW82 654 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.3■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 VPS18Q9P253 973 aa22.3■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 C9orf172C9J069 976 aa22.29■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 CCL4P13236 92 aa22.29■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 TEX44Q53QW1 395 aa22.29■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.29■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 TTC9Q92623 222 aa22.29■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM159Q96B96 161 aa22.29■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 KCNK6Q9Y257 313 aa22.29■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.28■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 PEX6Q13608 980 aa22.28■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.28■■□□□ 1.16
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KDELR3-202ENST00000409006 PMEPA1Q969W9 287 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 UBP1Q9NZI7 540 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF711Q9Y462 761 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.28■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 AURKAO14965 403 aa22.27■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CST8O60676 142 aa22.27■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 SLC4A1P02730 911 aa22.27■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ACP5P13686 325 aa22.27■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
KDELR3-202ENST00000409006 FASLGP48023 281 aa22.27■■□□□ 1.16
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