RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTPN2P17706 415 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AGAP20933 346 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAOAP21397 527 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL4RP24394 825 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRIM2P49643 509 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAD23BP54727 409 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLDN2P57739 230 aa0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 TEAD2Q15562 447 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C2orf68Q2NKX9 166 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EIPR1Q53HC9 387 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RUNDC3AQ59EK9 446 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM102BQ5T8I3 360 aa0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF280DQ6N043 979 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPP4R4Q6NUP7 873 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 C11orf42Q8N5U0 333 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF566Q969W8 418 aa0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF570Q96NI8 536 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCRT1Q9BWW7 348 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTDSP1Q9GZU7 261 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WFDC1Q9HC57 220 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BAG5Q9UL15 447 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DAPP1Q9UN19 280 aa0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.36□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A0G2JNG1 304 aa0.35□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa0.35□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 FFAR2O15552 330 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NCK2O43639 380 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PLA2G6O60733 806 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CSF1P09603 554 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RSPH10BP0C881 870 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCNAP12004 261 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ETFAP13804 333 aa0.35□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 EPHA2P29317 976 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SERPINA4P29622 427 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ELF1P32519 619 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HNF1BP35680 557 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PNPLA4P41247 253 aa0.35□□□□□ -2.35
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RNU6-1254P-201ENST00000391266 CALCOCO2Q13137 446 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITGADQ13349 1161 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACVR2BQ13705 512 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KIR2DS5Q14953 304 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC18A3Q16572 532 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C3AR1Q16581 482 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C2orf83Q53S99 150 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC45A4Q5BKX6 768 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARHGEF16Q5VV41 709 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NFRKBQ6P4R8 1299 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
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