RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC00862A6NCI5 91 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 XPNPEP2O43895 674 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TLL1O43897 1013 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TBC1D4O60343 1298 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 C7P10643 843 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SRCP12931 536 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB3AP20336 220 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SERPINB9P50453 376 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RGS1Q08116 209 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RIN1Q13671 783 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 MFSD10Q14728 455 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SGCAQ16586 387 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 KIF19Q2TAC6 998 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 FUT11Q495W5 492 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 WDR44Q5JSH3 913 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 GLYATQ6IB77 296 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 BEND5Q7L4P6 421 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 STK32CQ86UX6 486 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TNIP3Q96KP6 325 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 STRA6Q9BX79 667 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 EDARQ9UNE0 448 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 GINS2Q9Y248 185 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CSADQ9Y600 493 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.48□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 PLATP00750 562 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 PROZP22891 400 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 HMGCLP35914 325 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF273Q14593 569 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT39Q6A163 491 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 REP15Q6BDI9 236 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 XKRXQ6PP77 449 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 OR8K5Q8NH50 307 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 IP6K1Q92551 441 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM245Q9H330 911 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 BCORQ6W2J9 1755 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 H0YAE9 185 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CSF2P04141 144 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SELLP14151 372 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CD36P16671 472 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CSKP41240 450 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 VAMP7P51809 220 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 POU5F1BQ06416 359 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TFDP2Q14188 446 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM199Q8N511 208 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 AMER2Q8N7J2 671 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 WDR48Q8TAF3 677 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 NCLNQ969V3 563 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CPXM1Q96SM3 734 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RDH8Q9NYR8 311 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.47□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.46□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 NUMBP49757 651 aa8.46□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.46□□□□□ -1.05
NHLRC3-201ENST00000379599 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms