RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 UNC5BQ8IZJ1 945 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 APOLD1Q96LR9 279 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CDH19Q9H159 772 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RCCD1A6NED2 376 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 COX4I1P13073 169 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GRIA3P42263 894 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 UGT2B15P54855 530 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RALGDSQ12967 914 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NR1D2Q14995 579 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 UBXN11Q5T124 520 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MARK4Q96L34 752 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 WWP2O00308 870 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR10H3O60404 316 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SLC22A3O75751 556 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GRB14Q14449 540 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DYTNA2CJ06 578 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MED26O95402 600 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CFIP05156 583 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ATP12AP54707 1039 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TRIQKQ629K1 86 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C5orf34Q96MH7 638 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TSSK3Q96PN8 268 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CD84Q9UIB8 345 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FSTL1Q12841 308 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 IRGCQ6NXR0 463 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DLK2Q6UY11 383 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CUZD1Q86UP6 607 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PSMG2Q969U7 264 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CDKN2BP42772 138 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF132P52740 706 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PNLIPRP1P54315 467 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MREGQ8N565 214 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SHBGP04278 402 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 EPHA3P29320 983 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 COX10Q12887 443 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ADGRF1Q5T601 910 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FAM171BQ6P995 826 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TFAP2BQ92481 460 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLN6Q9NWW5 311 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SUV39H1O43463 412 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLDN9O95484 217 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ESR1P03372 595 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NT5EP21589 574 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NSG1P42857 185 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CARD16Q5EG05 197 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HMGB4Q8WW32 186 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HAPLN3Q96S86 360 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PCSK2P16519 638 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 KIR3DL1P43629 444 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MED27Q6P2C8 311 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms