RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR13H1Q8NG92 308 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 JADE3Q92613 823 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SGF29Q96ES7 293 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VMP1Q96GC9 406 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LOXL4Q96JB6 756 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PBKQ96KB5 322 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RNF157Q96PX1 679 aa4.42□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF14O43557 240 aa4.42□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 BRAFP15056 766 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB4P28070 264 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 DSELQ8IZU8 1212 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 CXorf38Q8TB03 319 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IFI44Q8TCB0 444 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HIC2Q96JB3 615 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YVX5 310 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPC4 97 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF185O15231 689 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CFLARO15519 480 aa4.41□□□□□ -1.7
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