RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.37■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 SPATA6LQ8N4H0 392 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TMIEQ8NEW7 156 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF398Q8TD17 642 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SCYL1Q96KG9 808 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C20orf27Q9GZN8 174 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.37■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.37■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.37■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGEF7Q14155 803 aa15.36■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.36■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 FAM129BQ96TA1 746 aa15.36■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 APODP05090 189 aa15.35■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 ITGB7P26010 798 aa15.35■□□□□ 0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 PAQR3Q6TCH7 311 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NXPE1Q8N323 547 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GPR21Q99679 349 aa15.35■□□□□ 0.05
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