RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 THEM5Q8N1Q8 247 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 EMC1Q8N766 993 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FRMD1Q8N878 549 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM71BQ8TC56 605 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM74Q96NL1 305 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PSKH2Q96QS6 385 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC22A12Q96S37 553 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NMUR1Q9HB89 426 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 OSER1Q9NX31 292 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 QPCTLQ9NXS2 382 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF69Q9UC07 566 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PSME2Q9UL46 239 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 COG5Q9UP83 839 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MTCH2Q9Y6C9 303 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SMIM30A4D0T7 59 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ERBB2P04626 1255 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 C8AP07357 584 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SOX18P35713 384 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCR2P41597 374 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DGKGP49619 791 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GSK3AP49840 483 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCT8P50990 548 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC5A3P53794 718 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BCAT1P54687 386 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 OGDHQ02218 1023 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ADIGQ0VDE8 80 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MORF4L2Q15014 288 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NCF4Q15080 339 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NDUFA5Q16718 116 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SGO1Q5FBB7 561 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 VSTM1Q6UX27 236 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GAREM2Q75VX8 874 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SCD5Q86SK9 330 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DPP10Q8N608 796 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KREMEN2Q8NCW0 462 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 VPS50Q96JG6 964 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SPXQ9BT56 116 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LRRC3Q9BY71 257 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PKIBQ9C010 78 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RNF32Q9H0A6 362 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TLE6Q9H808 572 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IL21Q9HBE4 155 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KLHL1Q9NR64 748 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ATAD3AQ9NVI7 634 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HESX1Q9UBX0 185 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM120BA0PK00 339 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM92AA1XBS5 289 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NEMP1O14524 444 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RASGRF2O14827 1237 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GPR37O15354 613 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SSX5O60225 188 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PNPP00491 289 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MPOP05164 745 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms