RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TEX44Q53QW1 395 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL35Q6PF15 583 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 STRADAQ7RTN6 431 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CDK14O94921 469 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PEX6Q13608 980 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 RELTQ969Z4 430 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ENPP3O14638 875 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CILPO75339 1184 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 NOMO1Q15155 1222 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PACS2Q86VP3 889 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A6Q92581 669 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 UGT1A5P35504 534 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 COMMD9Q9P000 198 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TP53INP1Q96A56 240 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 MPP1Q00013 466 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 GPR107Q5VW38 600 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf34Q96MH7 638 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ALOX15BO15296 676 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 LGALS3BPQ08380 585 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 DNASE1L2Q92874 299 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 TCF25Q9BQ70 676 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC182A6NF36 153 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ARL5CA6NH57 179 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 FPGTO14772 594 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP1BP68106 108 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 SIN3BO75182 1162 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PIGKQ92643 395 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TCF12Q99081 682 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 PPM1JQ5JR12 505 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 EXD2Q9NVH0 621 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 SEPT4O43236 478 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 IDSP22304 550 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GBE1Q04446 702 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FOLH1Q04609 750 aa22.27■■□□□ 1.15
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