RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MATN4O95460 622 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 LDLRP01130 860 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NFKB2Q00653 900 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MANEALQ5VSG8 457 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SMARCD1Q96GM5 515 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TMEM209Q96SK2 561 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NANOGQ9H9S0 305 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CXCL11O14625 94 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 AXIN1O15169 862 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IRAK2O43187 625 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CPNE6O95741 557 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MMP2P08253 660 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IL7RP16871 459 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ZNF12P17014 697 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CCR1P32246 355 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TTKP33981 857 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PHEXP78562 749 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ITGADQ13349 1161 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD34AQ69YU3 496 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 LPPQ93052 612 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ATP13A1Q9HD20 1204 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PP18 115 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 UNCXA6NJT0 531 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 C1RP00736 705 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IGLV3-25P01717 112 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TIGD2Q4W5G0 525 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SULT1C4O75897 302 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PIRTP0C851 137 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 FDXRP22570 491 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IL12AP29459 219 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 BFSP2Q13515 415 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ESAMQ96AP7 390 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.16■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TTC3P53804 2025 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ZNF773Q6PK81 442 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PDPRQ8NCN5 879 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CHPT1Q8WUD6 406 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GAD1Q99259 594 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ACOX2Q99424 681 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ARNT2Q9HBZ2 717 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ZNF639Q9UID6 485 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DGKBQ9Y6T7 804 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 UPK1AO00322 258 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CNTN5O94779 1100 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 FCGR1AP12314 374 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IST1P53990 364 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GSTM4Q03013 218 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SELPLGQ14242 412 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 AAK1Q2M2I8 961 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SIRPB2Q5JXA9 342 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D21Q8IYX1 336 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MFSD1Q9H3U5 465 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ARL5AQ9Y689 179 aa25.15■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MROH6A6NGR9 719 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 C7P10643 843 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 HOXC13P31276 330 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GOLM1Q8NBJ4 401 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 HS3ST4Q9Y661 456 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SOBPA7XYQ1 873 aa25.14■■□□□ 1.61
SENP3-201ENST00000321337 E9PAM4 449 aa25.14■■□□□ 1.61
SENP3-201ENST00000321337 SEC14L2O76054 403 aa25.14■■□□□ 1.61
SENP3-201ENST00000321337 BCL10O95999 233 aa25.14■■□□□ 1.61
SENP3-201ENST00000321337 ALBP02768 609 aa25.14■■□□□ 1.61
SENP3-201ENST00000321337 MYL3P08590 195 aa25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms