RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDND1Q9NY35 253 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC1BQ9P126 229 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP290O15078 2479 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN8A6NHC0 703 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC34A8MYJ7 566 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM24O15164 1050 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ECI2O75521 394 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TGDSO95455 350 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN7O95471 211 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1BP01584 269 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PYGLP06737 847 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RBP1P09455 135 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ALPIP09923 528 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35E2BP0CK96 405 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGALP20701 1170 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 BGNP21810 368 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 XPAP23025 273 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGER3P43115 390 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A11P48066 632 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CSRP3P50461 194 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAA2P54646 552 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPHQ12797 758 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 STX3Q13277 289 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF7Q14155 803 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CHI3L2Q15782 390 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TYSND1Q2T9J0 566 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR33Q49SQ1 333 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 VITQ6UXI7 678 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MTSS1LQ765P7 747 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC7BQ86TV6 843 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP97Q8IW35 865 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SORCS1Q8WY21 1168 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL32Q96NJ5 620 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MYADMQ96S97 322 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 BRD9Q9H8M2 597 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD18Q9NS91 495 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 COPG2Q9UBF2 871 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DKK3Q9UBP4 350 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SUN2Q9UH99 717 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IL36AQ9UHA7 158 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CHD5Q8TDI0 1954 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM13O60858 407 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LEFTY1O75610 366 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0754O94854 1291 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRNPP04156 253 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINE1P05121 402 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 F7P08709 466 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL2P10916 166 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RALBP11234 206 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF30P17039 623 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FCARP24071 287 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIA2P42262 883 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ADARP55265 1226 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 XIAPP98170 497 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ACAP2Q15057 778 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF805Q5CZA5 627 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT3A1Q6NUS8 523 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CRTC1Q6UUV9 634 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX20Q7Z614 316 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST14Q8NCH0 376 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TMIEQ8NEW7 156 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF398Q8TD17 642 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP4R1Q8TF05 950 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf26Q96N11 449 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM14Q96QK8 99 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NDNQ99608 321 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms