RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GM2AP17900 193 aa27.26■■□□□ 1.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AOC1P19801 751 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A1P22309 533 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A4P22310 534 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A3P35503 534 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A5P35504 534 aa27.26■■□□□ 1.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEL1L3Q68CR1 1132 aa27.26■■□□□ 1.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PGM2Q96G03 612 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOJQ9H4E5 214 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD93Q9NPY3 652 aa27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 S1PR4O95977 384 aa27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV3-19P01714 112 aa27.26■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINA9Q86WD7 417 aa27.26■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3GL2Q99962 352 aa27.26■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA4FO95754 770 aa27.25■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP7D1Q3KQU3 841 aa27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRP8Q86W28 1048 aa27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDAP1Q8TB36 358 aa27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR39O43194 453 aa27.24■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA2BP08514 1039 aa27.24■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LIMK2P53671 638 aa27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPTQ07507 201 aa27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM31Q5JXX7 168 aa27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 MROH9Q5TGP6 573 aa27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAET1GQ6H3X3 334 aa27.24■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa27.24■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK6Q92876 244 aa27.23■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYL1Q9Y2S2 319 aa27.23■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RBFAQ8N0V3 343 aa27.22■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DCUN1D1Q96GG9 259 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS35Q96QK1 796 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 AXIN1O15169 862 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYF2O95926 243 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCCBP05166 539 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC12A2P55011 1212 aa27.21■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2CAP67775 309 aa27.21■■□□□ 1.95
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