RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 RFX8Q6ZV50 586 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SEC14L1Q92503 715 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 AP2M1Q96CW1 435 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CASS4Q9NQ75 786 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 LRBAP50851 2863 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PIPSLA2A3N6 862 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SOD1P00441 154 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CCNYL3P0C7X3 344 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC2A4P14672 509 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TNFAIP3P21580 790 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PSMA2P25787 234 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PGDP52209 483 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 RIPPLY3P57055 190 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 FOXM1Q08050 763 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 IL11RAQ14626 422 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SASS6Q6UVJ0 657 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 USP45Q70EL2 814 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC9B2Q86UD5 537 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 AVL9Q8NBF6 648 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 GALNT6Q8NCL4 622 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SCRN2Q96FV2 425 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 NUDCD1Q96RS6 583 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ABCG8Q9H221 673 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 NOD2Q9HC29 1040 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PRKAB1Q9Y478 270 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa16■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 WIPF3A6NGB9 483 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PYGLP06737 847 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 COL8A1P27658 744 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TNFRSF8P28908 595 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 MAXP61244 160 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 STX1AQ16623 288 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 IYDQ6PHW0 289 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM135Q86UB9 458 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 BBS5Q8N3I7 341 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PGBD5Q8N414 524 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SCAMP4Q969E2 229 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PEBP4Q96S96 227 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.99■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 C21orf140B9A014 251 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SNX2O60749 519 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 DNAJB5O75953 348 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 KIAA0754O94854 1291 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 NDUFA10O95299 355 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CLDN1O95832 211 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 MT-ND3P03897 115 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF28P17035 718 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CASP14P31944 242 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 NADK2Q4G0N4 442 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRC66Q68CR7 880 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 THAP4Q8WY91 577 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF599Q96NL3 588 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 AGAP2Q99490 1192 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 AGPAT1Q99943 283 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ANO10Q9NW15 660 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PADI1Q9ULC6 663 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 KCNK6Q9Y257 313 aa15.98■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa15.97■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A0G2JNG1 304 aa15.97■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 LILRA5A6NI73 299 aa15.97■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 OR5K4A6NMS3 321 aa15.97■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.97■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 KIR2DS3K7RE56 304 aa15.97■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 LRCH4O75427 683 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms