RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SPATA6LQ8N4H0 392 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 RORBQ92753 470 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PCED1BQ96HM7 432 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 UROC1Q96N76 676 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 RAB26Q9ULW5 256 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 VWA7Q9Y334 891 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TCAF1Q9Y4C2 921 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 GUCY1B2O75343 617 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 KCNE1P15382 129 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 LBPP18428 481 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF846Q147U1 533 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 DDR2Q16832 855 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 USP41Q3LFD5 358 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 C7orf61Q8IZ16 206 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SH3BP4Q9P0V3 963 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 NUDT5Q9UKK9 219 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TP73O15350 636 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TREHO43280 583 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ACSL4O60488 711 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 NPHS1O60500 1241 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SNNO75324 88 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 DNTTP04053 509 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 FOSL2P15408 326 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 OR1E1P30953 314 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 FAM136AQ96C01 138 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 EBF3Q9H4W6 596 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 MIEF1Q9NQG6 463 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PSME2Q9UL46 239 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PSAT1Q9Y617 370 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 IPO13O94829 963 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CXCL14O95715 111 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CLK3P49761 638 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TCEA2Q15560 299 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TSNQ15631 228 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 DGUOKQ16854 277 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 RAB6CQ53S08 254 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CUZD1Q86UP6 607 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 FAM129BQ96TA1 746 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 RAB6CQ9H0N0 254 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CLIC5Q9NZA1 410 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PGAP2Q9UHJ9 254 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC162PA2VCL2 907 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 MATN3O15232 486 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 LAG3P18627 525 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ACADLP28330 430 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SERPINA4P29622 427 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 GPR1P46091 355 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 STARP49675 285 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 BCL2L1Q07817 233 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 HERC3Q15034 1050 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TEAD4Q15561 434 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 NRF1Q16656 503 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 INAVAQ3KP66 663 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 LPCAT2Q7L5N7 544 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CAMK1DQ8IU85 385 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 NPAS2Q99743 824 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 OSBPL11Q9BXB4 747 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL1Q9NR64 748 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TRAF6Q9Y4K3 522 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 MYBPHLA2RUH7 354 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 EFCAB10A6NFE3 127 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ATP6V1B2P21281 511 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 NAA20P61599 178 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 FUT11Q495W5 492 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 EPGNQ6UW88 154 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 TAC4Q86UU9 113 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 STAG3L4Q8TBR4 150 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 LPPQ93052 612 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SYT17Q9BSW7 474 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PIRO00625 290 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms