RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 ARL15Q9NXU5 204 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 GALPQ9UBC7 116 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IPPQ9Y573 584 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CENPXA8MT69 81 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 BCKDKO14874 412 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF12P17014 697 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RHOAP61586 193 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CCL15Q16663 113 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CEP78Q5JTW2 689 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 LRRC58Q96CX6 371 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RGL2O15211 777 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 KRT6AP02538 564 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 KRT6BP04259 564 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IMPDH2P12268 514 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 KRT6CP48668 564 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MXD1Q05195 221 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 OR4L1Q8NH43 312 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 NACC2Q96BF6 587 aa15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 NDUFS2O75306 463 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RGS20O76081 388 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 EDN1P05305 212 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RHOCP08134 193 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 GRIA2P42262 883 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 INHBCP55103 352 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SEMG2Q02383 582 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TRIM32Q13049 653 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SYTL3Q4VX76 610 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SORT1Q99523 831 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 KRT84Q9NSB2 600 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 VPS4AQ9UN37 437 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SDHDO14521 159 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TMBIM1Q969X1 311 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 A8MU76 341 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CYBBP04839 570 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 VBP1P61758 197 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CDH18Q13634 790 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TAC4Q86UU9 113 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CEP97Q8IW35 865 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ENKURQ8TC29 256 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 HM13Q8TCT9 377 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.63■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 UFM1P61960 85 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CDK18Q07002 472 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 GPR162Q16538 588 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 GPR156Q8NFN8 814 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 FZD8Q9H461 694 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 H3BNH8 94 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TSPAN1O60635 241 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IGFBP5P24593 272 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IL12RB1P42701 662 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CRATP43155 626 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 HSPA7P48741 367 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 HMGCS1Q01581 520 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CREB5Q02930 508 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PMS2P3Q13401 168 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SYT12Q8IV01 421 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 FIBCD1Q8N539 461 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.62■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms