RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PIRTP0C851 137 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TNNT1P13805 278 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ALDH4A1P30038 563 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CSF2RBP32927 897 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 MAGEA1P43355 309 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 FASLGP48023 281 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 UCNP55089 124 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 WASHC5Q12768 1159 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TEX44Q53QW1 395 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 BROXQ5VW32 411 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 USP53Q70EK8 1073 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 GPR26Q8NDV2 337 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SLC39A7Q92504 469 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TEKT5Q96M29 485 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 GLOD4Q9HC38 313 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PISDQ9UG56 409 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ATMQ13315 3056 aa14.77□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 A6NCN8 305 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 C9orf172C9J069 976 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 K7ENP7 123 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 AGRPO00253 132 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PSTPIP1O43586 416 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CST8O60676 142 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 MARCKSL1P49006 195 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 NR2C2P49116 596 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ARSDP51689 593 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 DYNLT1P63172 113 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CDK18Q07002 472 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 VAC14Q08AM6 782 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 LRP8Q14114 963 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 LLGL1Q15334 1064 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TGIF1Q15583 401 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 AMZ1Q400G9 498 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PIM3Q86V86 326 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SFRP1Q8N474 314 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TTC9Q92623 222 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TMEM159Q96B96 161 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.76□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 AURKAO14965 403 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 SPOPO43791 374 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 NUAK1O60285 661 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ASMTLO95671 621 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 LIMK2P53671 638 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 DCDC1P59894 354 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PEX6Q13608 980 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PCSK7Q16549 785 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 MAP9Q49MG5 647 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 IYDQ6PHW0 289 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 KDELC1Q6UW63 502 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 USP7Q93009 1102 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 CMKLR1Q99788 373 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 RMI1Q9H9A7 625 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PDP2Q9P2J9 529 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 ZNF711Q9Y462 761 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.75□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.74□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.74□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.74□□□□□ -0.05
GATC-201ENST00000229384 RCCD1A6NED2 376 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms