RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000182527.3

TRAM2-201, Transcript of translocation associated membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAM2, Length 6,908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-201ENST00000182527 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 BMP7P18075 431 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ERV3-1Q14264 604 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF677Q86XU0 584 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MTRRQ9UBK8 725 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PPT2Q9UMR5 302 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 STRCQ7RTU9 1775 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 HIDE1A8MVS5 230 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 JAK2O60674 1132 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 KCNK5O95279 499 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ACP5P13686 325 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PRLRP16471 622 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SOX9P48436 509 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MTAPQ13126 283 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PTERQ96BW5 349 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CFL2Q9Y281 166 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 WNT9AO14904 365 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CHUKO15111 745 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 NOS3P29474 1203 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 FOXN2P32314 431 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 HNF4AP41235 474 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MAPRE2Q15555 327 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PARM1Q6UWI2 310 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 KRT74Q7RTS7 529 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 KAT2BQ92831 832 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MCEEQ96PE7 176 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 KLHL1Q9NR64 748 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ADAMTS4O75173 837 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TRIM49P0CI25 452 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TRIM49CP0CI26 452 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CEACAM1P13688 526 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 GUCY2FP51841 1108 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CAV1Q03135 178 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF33BQ06732 778 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SPATA1Q5VX52 437 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF611Q8N823 705 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TEPSINQ96N21 525 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 IL21RQ9HBE5 538 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 C2orf74A8MZ97 194 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 AGPSO00116 658 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CKMT2P17540 419 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CTPS1P17812 591 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SLC29A2Q14542 456 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 FAM171BQ6P995 826 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 VPS11Q9H270 941 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SERTM1A2A2V5 107 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 TRIM64BA6NI03 449 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 GABRR3A8MPY1 467 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 RAD51CO43502 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 E2F6O75461 281 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 EGFP01133 1207 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF28P17035 718 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 HOXD12P35452 270 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 RAB39AQ14964 217 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 CCNJLQ8IV13 435 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAM2-201ENST00000182527 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms