RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	C1orf226	A1L170	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	BECN2	A8MW95	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538		B4DGG1	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TIMM23	O14925	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ZIC3	O60481	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	AVIL	O75366	819 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CH25H	O95992	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DNTT	P04053	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TPO	P07202	933 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CYC1	P08574	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SELL	P14151	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HOXB2	P14652	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FOXM1	Q08050	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TRAF1	Q13077	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GPS2	Q13227	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HNF4G	Q14541	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DCST1	Q5T197	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SCML4	Q8N228	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538		H3BNX3	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538		M0QZ24	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SPINT2	O43291	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	NR4A2	P43354	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	LIG4	P49917	911 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MXI1	P50539	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ARSE	P51690	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	RASA2	Q15283	850 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HS3ST1	O14792	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ADAM20	O43506	726 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SERPINI2	O75830	405 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TOMM40	O96008	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	EGF	P01133	1207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ICAM1	P05362	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	G6PD	P11413	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CDK4	P11802	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CDC25A	P30304	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MSH2	P43246	934 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CXCL9	Q07325	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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