RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627490.2

PBX1-222, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PBX1, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-222ENST00000627490 YME1L1Q96TA2 773 aa20.11■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.11■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 GID8Q9NWU2 228 aa20.11■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.11■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 APPL1Q9UKG1 709 aa20.11■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 LDB2O43679 373 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 OR6B1O95007 311 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 GLP2RO95838 553 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ASLP04424 464 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 HSD17B1P14061 328 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 CD1DP15813 335 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 PBX3P40426 434 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 GPR158Q5T848 1215 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 IYDQ6PHW0 289 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 INSL6Q9Y581 213 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.1■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 OR6C75A6NL08 312 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 DRGXA6NNA5 263 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TMCC1O94876 653 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ETS2P15036 469 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ZNF23P17027 643 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 SYN1P17600 705 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 RPS6KA3P51812 740 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ATP6V0D1P61421 351 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 DSC2Q02487 901 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 GRIK2Q13002 908 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 INPP5AQ14642 412 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 MYLK3Q32MK0 819 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 MIER2Q8N344 545 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TCF12Q99081 682 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 C7orf72A4D263 438 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 H7C4K7 107 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 J3KR12 359 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 AZIN1O14977 448 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TBC1D4O60343 1298 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 H6PDO95479 791 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 C7P10643 843 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 PPM1AP35813 382 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 PLK1P53350 603 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 KANK2Q63ZY3 851 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ZNF599Q96NL3 588 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 IL37Q9NZH6 218 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.08■□□□□ 0.81
PBX1-222ENST00000627490 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 MAGEA11P43364 429 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 MAPKAPK2P49137 400 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 PGFP49763 221 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 ARSDP51689 593 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 SLC7A2P52569 658 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.08■□□□□ 0.8
PBX1-222ENST00000627490 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms