RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 UGT2B4P06133 528 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTPS1P17812 591 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SAT1P21673 171 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARNTP27540 789 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MC4RP32245 332 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC26A3P40879 764 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKAA2P54646 552 aa16.73■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KDSRQ06136 332 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRM2Q14416 872 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR33Q49SQ1 333 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 RDH11Q8TC12 318 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNASE1L2Q92874 299 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDH19Q9H159 772 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GGT7Q9UJ14 662 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.73■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GJA4P35212 333 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNF1BP35680 557 aa16.72■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MAGEA12P43365 314 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 STC1P52823 247 aa16.72■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SDE2Q6IQ49 451 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SH2D5Q6ZV89 423 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 NELL1Q92832 810 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ULK4Q96C45 1275 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM107BQ9H098 131 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 HPS4Q9NQG7 708 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL17CQ9P0M4 197 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 VWA7Q9Y334 891 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCTD3Q9Y597 815 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 HMX2A2RU54 273 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC34A8MYJ7 566 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 H3BMM5 538 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 EBAG9O00559 213 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 HAUS5O94927 633 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 S1PR4O95977 384 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKCGP05129 697 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 C2P06681 752 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 VIPR1P32241 457 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTGER3P43115 390 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARSDP51689 593 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELP6Q0PNE2 266 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGA9Q13797 1035 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MPP2Q14168 576 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.71■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMIEQ8NEW7 156 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 FRS2Q8WU20 508 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCYL1Q96KG9 808 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL4A2P08572 1712 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF292O60281 2723 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPAN11A1L157 253 aa16.7■□□□□ 0.26
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