RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM71Q6P5X7 295 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 COX14Q96I36 57 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP2Q99490 1192 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PDP2Q9P2J9 529 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 COL12A1Q99715 3063 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SMTNL1A8MU46 457 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PYGLP06737 847 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 STC1P52823 247 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ITKQ08881 620 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 LRP8Q14114 963 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 IHHQ14623 411 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT13Q8IUC8 556 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 FAM71BQ8TC56 605 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SLC37A2Q8TED4 501 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD6Q96KE9 485 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A1Q9NY26 324 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 B4E171 279 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN7P41732 249 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 SFRP1Q8N474 314 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 IL22RA1Q8N6P7 574 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 EXD1Q8NHP7 514 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 MAML1Q92585 1016 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 THAP2Q9H0W7 228 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A18Q9H1K4 315 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP6O43182 974 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 PPFIA2O75334 1257 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 EML2O95834 649 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CD48P09326 243 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 LIFP15018 202 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CES1P23141 567 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 EPHB1P54762 984 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT2Q10471 571 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 FIGNQ5HY92 759 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 HGSNATQ68CP4 663 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A3Q99624 504 aa24.75■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.75■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 CYSRT1A8MQ03 144 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 RAB15P59190 212 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 DSC2Q02487 901 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 NR1I3Q14994 352 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 BMPERQ8N8U9 685 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 OR10G6Q8NH81 332 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 PTPN13Q12923 2485 aa24.73■■□□□ 1.55
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PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K6O95382 1288 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ASMTLO95671 621 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 PRLP01236 227 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF165P49910 485 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ARSEP51690 589 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 FATE1Q969F0 183 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 VPS18Q9P253 973 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 AMACRQ9UHK6 382 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.73■■□□□ 1.55
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