RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NPY5RQ15761 445 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC15A2Q16348 729 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KCTD21Q4G0X4 260 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 EMC10Q5UCC4 262 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GALNT17Q6IS24 598 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MTHFD1LQ6UB35 978 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 UNC13DQ70J99 1090 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FRMD5Q7Z6J6 570 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZBTB46Q86UZ6 589 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CDH26Q8IXH8 852 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 DTX3Q8N9I9 347 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CAMKVQ8NCB2 501 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GLIS3Q8NEA6 775 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 OR10H5Q8NGA6 315 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 AGAP11Q8TF27 550 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 LGALS12Q96DT0 336 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GIMAP5Q96F15 307 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 HARBI1Q96MB7 349 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 C5orf34Q96MH7 638 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHL32Q96NJ5 620 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM79Q9BSE2 394 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TLR10Q9BXR5 811 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KATNBL1Q9H079 304 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RNPEPQ9H4A4 650 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GSTO2Q9H4Y5 243 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 IL21RQ9HBE5 538 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MAGEE1Q9HCI5 957 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZFP14Q9HCL3 533 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SERTAD4Q9NUC0 356 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GTSE1Q9NYZ3 720 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KCND2Q9NZV8 630 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF225Q9UK10 706 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ABCG2Q9UNQ0 655 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ALG5Q9Y673 324 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NEMP2A6NFY4 417 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM183AA6NL82 134 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ERVV-2B6SEH9 535 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 L7N2F9 121 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PRAMEF11O60813 436 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GLCEO94923 617 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ARHGEF15O94989 841 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PRH1P02810 166 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 IFNA6P05013 189 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NPPBP16860 134 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CYP11B2P19099 503 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 IL12BP29460 328 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 HNF4AP41235 474 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CX3CR1P49238 355 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GZMKP49863 264 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 AIF1P55008 147 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MTCP1P56278 107 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 VAMP2P63027 116 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM110CQ1W6H9 321 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 C2orf27AQ580R0 203 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FIGNQ5HY92 759 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GNASQ5JWF2 1037 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 LIPKQ5VXJ0 399 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF367Q7RTV3 350 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MICU3Q86XE3 530 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SLFN12Q8IYM2 578 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 BEST3Q8N1M1 668 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TEX19Q8NA77 164 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TBC1D15Q8TC07 691 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ATP8B4Q8TF62 1192 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FIG4Q92562 907 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CLPTM1LQ96KA5 538 aa2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms