RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ANXA3P12429 323 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 KAT2AQ92830 837 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 GMCL1Q96IK5 515 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP24386 653 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 MTHFRP42898 656 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 RHOAP61586 193 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SPIBQ01892 262 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 PRKG2Q13237 762 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 MIIPQ5JXC2 388 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SNX20Q7Z614 316 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SKA3Q8IX90 412 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 FAM47BQ8NA70 645 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF358Q9NW07 568 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A3O75751 556 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SPARCP09486 303 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 GRIA1P42261 906 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 RAB5BP61020 215 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 RAB10P61026 200 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4F2P78329 520 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4F3Q08477 520 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF613Q6PF04 617 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC46Q96FV0 321 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRT-209ENST00000612229 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OTCP00480 354 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DNTTP04053 509 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CRISP1P54107 249 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MED22Q15528 200 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EIPR1Q53HC9 387 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BORCS7Q96B45 105 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 VPS28Q9UK41 221 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EVPLQ92817 2033 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TTC34A8MYJ7 566 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UBXN7O94888 489 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KCNA5P22460 613 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HTR1BP28222 390 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CRHR1P34998 444 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TROAPQ12815 778 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CDK10Q15131 360 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CERS2Q96G23 380 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 CD320Q9NPF0 282 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LIASO43766 372 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR1I1O60431 355 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RAMP2O60895 175 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 PRKCIP41743 596 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ADIGQ0VDE8 80 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SPATS1Q496A3 300 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CNTD1Q8N815 330 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 THAP6Q8TBB0 222 aa6.96□□□□□ -1.3
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