RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTD1Q8N815 330 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC46A1Q96NT5 459 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 LYSMD1Q96S90 227 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 GPR63Q9BZJ6 419 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC25A51Q9H1U9 297 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 APC2O95996 2303 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMA5O15230 3695 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 RGSL1A5PLK6 1076 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MTSS1O43312 755 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ECEL1O95672 775 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FGF1P05230 155 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MMP2P08253 660 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 JMJD7P0C870 316 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CDKN2BP42772 138 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SPINT3P49223 89 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MAZP56270 477 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CDK18Q07002 472 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 IHHQ14623 411 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 AMZ1Q400G9 498 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 TEX44Q53QW1 395 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 TFDP3Q5H9I0 405 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 RAB11FIP2Q7L804 512 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 JAMLQ86YT9 394 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 AGAP2Q99490 1192 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FERMT1Q9BQL6 677 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA16Q9BXB7 569 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 GLOD4Q9HC38 313 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 RAD18Q9NS91 495 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAMTS20P59510 1910 aa19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 AGRPO00253 132 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CASC3O15234 703 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 KLK10O43240 276 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PMPCBO75439 489 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FUCA1P04066 466 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF75DP51815 510 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 HADHBP55084 474 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PHF19Q5T6S3 580 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRED1Q7Z699 444 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PIM3Q86V86 326 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 NRROSQ86YC3 692 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 TMTC1Q8IUR5 882 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SFTPA2Q8IWL1 248 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SPACA3Q8IXA5 215 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 HAUS1Q96CS2 278 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CRELD1Q96HD1 420 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 OLFM3Q96PB7 478 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PANX2Q96RD6 677 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 UBP1Q9NZI7 540 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SHOC2Q9UQ13 582 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1W2PQM1 296 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PLD2O14939 933 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SOD1P00441 154 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PIRTP0C851 137 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CETN2P41208 172 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 UCNP55089 124 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CXADRP78310 365 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 LRP8Q14114 963 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM182AQ5T1J6 154 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ALS2CLQ60I27 953 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 C11orf63Q6NUN7 778 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 KATNAL2Q8IYT4 538 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA22Q8NHS9 363 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 DPH1Q9BZG8 443 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ASCL3Q9NQ33 180 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 TFR2Q9UP52 801 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM208BQ5VWN6 2430 aa19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 LCA5LO95447 670 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPN3P26045 913 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 CTNNA2P26232 953 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 OR1D5P58170 312 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PYCR3Q53H96 274 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF569Q5MCW4 686 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 IGF2-ASQ6U949 168 aa19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54-211ENST00000609454 PID1Q7Z2X4 250 aa19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms