RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597816.5

LTBP4-218, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene LTBP4, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-218ENST00000597816 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 GUSBP11Q6P575 273 aa16.03■□□□□ 0.16
LTBP4-218ENST00000597816 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.03■□□□□ 0.16
LTBP4-218ENST00000597816 ARL10Q8N8L6 244 aa16.03■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 MAPK15Q8TD08 544 aa16.03■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.03■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.03■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 GNPDA1P46926 289 aa16.02■□□□□ 0.16
LTBP4-218ENST00000597816 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.02■□□□□ 0.16
LTBP4-218ENST00000597816 DOK6Q6PKX4 331 aa16.02■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.02■□□□□ 0.16
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LTBP4-218ENST00000597816 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF711Q9Y462 761 aa16.02■□□□□ 0.16
LTBP4-218ENST00000597816 F5H423 210 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 GEMP55040 296 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
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LTBP4-218ENST00000597816 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 PERM1Q5SV97 790 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.01■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.01■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 CTBSQ01459 385 aa16■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 PYCR3Q53H96 274 aa16■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 DEPDC7Q96QD5 511 aa16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 FSD1LQ9BXM9 530 aa16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 NRSN2Q9GZP1 204 aa16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 VPS18Q9P253 973 aa16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 DKK4Q9UBT3 224 aa16■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 SPO11Q9Y5K1 396 aa16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 UNC13CQ8NB66 2214 aa16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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LTBP4-218ENST00000597816 C5orf60A6NFR6 353 aa15.99■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 FADS2P1A8MWK0 482 aa15.99■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 AURKAO14965 403 aa15.99■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 AGTP01019 485 aa15.99■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LTBP4-218ENST00000597816 FGF1P05230 155 aa15.99■□□□□ 0.15
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