RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQY0 241 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LDB2O43679 373 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSL4O60488 711 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 B4GALT3O60512 393 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAM23O75077 832 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CLDN11O75508 207 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMPSTE24O75844 475 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PYGLP06737 847 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HMBSP08397 361 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP4P12644 408 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ELNP15502 786 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ACADVLP49748 655 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 STC1P52823 247 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HERVK_113P63132 956 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GNA12Q03113 381 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD51Q06609 339 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 NOGQ13253 232 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PIGGQ5H8A4 983 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CHSY3Q70JA7 882 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KBTBD6Q86V97 674 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC43Q8N309 656 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4L1Q8NH43 312 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ASB16Q96NS5 453 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CDRT15Q96T59 188 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPKQ9BS16 269 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TTPALQ9BTX7 342 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ALG9Q9H6U8 611 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PDFQ9HBH1 243 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SRRDQ9UH36 339 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SUFUQ9UMX1 484 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 MYLKQ15746 1914 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf81A6NN90 581 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ARVCFO00192 962 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KDELR3O43731 214 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PRMT3O60678 531 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KERAO60938 352 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFS3O75489 264 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CRCPO75575 148 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPA1O75762 1119 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SUPT7LO94864 414 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOCP08134 193 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 UQCRBP14927 111 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CD1DP15813 335 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CCR10P46092 362 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMD8P48556 350 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC11A1P49279 550 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 MBTPS1Q14703 1052 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF6Q15052 776 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GEN1Q17RS7 908 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATS1Q496A3 300 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 IL31Q6EBC2 164 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SIX5Q8N196 739 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms