RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 NRSN1Q8IZ57 195 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SFRP1Q8N474 314 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 NSMCE1Q8WV22 266 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5MQ9NPB1 228 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PDP2Q9P2J9 529 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K6O95382 1288 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RARAP10276 462 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB15P59190 212 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT13Q8IUC8 556 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A3Q99624 504 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PILRAQ9UKJ1 303 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTA1P02549 2419 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP4BO15327 924 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 IHHQ14623 411 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 BOLA3Q53S33 107 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAP47Q5SQN1 464 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF765Q7L2R6 523 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX26Q8N6G2 289 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10G6Q8NH81 332 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RTP4Q96DX8 246 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 COX14Q96I36 57 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CTRCQ99895 268 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRY4Q9C004 299 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 EPN3Q9H201 632 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH18Q9HCL0 1135 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAB1Q9Y478 270 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MU76 341 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX1O43812 170 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB6P35237 376 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCIP41743 596 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR10P46092 362 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP8Q14114 963 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBD1Q9UJT1 453 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YYE9 177 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX2-8O15522 239 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBC1P01850 177 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBL1P10243 752 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF30P17039 623 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 STC1P52823 247 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 HHEXQ03014 270 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP8Q86W28 1048 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM11Q96F44 468 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC45A3Q96JT2 553 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC6O75061 913 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ASMTLO95671 621 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MC2RQ01718 297 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ITKQ08881 620 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL30Q0D2K2 578 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NFATC2Q13469 925 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NLGN4XQ8N0W4 816 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF2Q8N183 169 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 EXD1Q8NHP7 514 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TEKT4Q8WW24 435 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPER2Q96P56 530 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ISCUQ9H1K1 167 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D29Q9UFV1 150 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD11O43934 449 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PYGLP06737 847 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAR1AP10644 381 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SKILP12757 684 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 DSC2Q02487 901 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MMRN1Q13201 1228 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD6Q96KE9 485 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 APMAPQ9HDC9 416 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK6Q9Y257 313 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CHKBQ9Y259 395 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IL4RP24394 825 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHB1P54762 984 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC20Q12834 499 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG1LQ6GMV1 187 aa25.42■■□□□ 1.66
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