RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 FUOMA2VDF0 154 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 THRAP10827 490 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 RHOQP17081 205 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 VCLP18206 1134 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 TYMPP19971 482 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 PMLP29590 882 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 RNF180Q86T96 592 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 OR1I1O60431 355 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 GPC4O75487 556 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 S100A1P23297 94 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 CYP2C18P33260 490 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 CSRP3P50461 194 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 AFMIDQ63HM1 303 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 USP34Q70CQ2 3546 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ENPP3O14638 875 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 ATF6P18850 670 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 CRABP2P29373 138 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 HADHAP40939 763 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 OR4D1Q15615 310 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 RTKNQ9BST9 563 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-205ENST00000587860 E7ENX8 843 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PSMD3O43242 534 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PEX1O43933 1283 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 CBFA2T3O75081 653 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 OR1D2P34982 312 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 CDK18Q07002 472 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 ATP1A4Q13733 1029 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 IYDQ6PHW0 289 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 ISCA2Q86U28 154 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 DDIASQ8IXT1 998 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SLC30A3Q99726 388 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PIF1Q9H611 641 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 TLR9Q9NR96 1032 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 VPS45Q9NRW7 570 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 VPS51Q9UID3 782 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SNAP91O60641 907 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 ITGB6P18564 788 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 DNAJB2P25686 324 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SH3BP2P78314 561 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PLIN5Q00G26 463 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 POU4F1Q01851 419 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 NRF1Q16656 503 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 LILRA2Q8N149 483 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SH3GL1Q99961 368 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 MARCH5Q9NX47 278 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PLK2Q9NYY3 685 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 KLKB1P03952 638 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 LINC00032P0C843 101 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-205ENST00000587860 SLC2A3P11169 496 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms