RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CFAP69A5D8W1 941 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 A8MUI8 341 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 PROB1E7EW31 1015 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CHADO15335 359 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF623O75123 536 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 SPAG6O75602 509 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 RFPL1O75677 317 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ATP5HO75947 161 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 RNF8O76064 485 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CD48P09326 243 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 VDRP11473 427 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TGM2P21980 687 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 SSTR1P30872 391 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CD52P31358 61 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 MSH2P43246 934 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 NEK3P51956 506 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC16A1P53985 500 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CDH6P55285 790 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADAM8P78325 824 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TFDP2Q14188 446 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 DPYSL3Q14195 570 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 E2F5Q15329 346 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 KYAT1Q16773 422 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 Q6ZVL8 140 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CHSY1Q86X52 802 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 GPR65Q8IYL9 337 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDIK1LQ8N165 341 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TTC39CQ8N584 583 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 KCTD6Q8NC69 237 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CXorf38Q8TB03 319 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 SPATA18Q8TC71 538 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF398Q8TD17 642 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGAP11Q8TF27 550 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 INPP5DQ92835 1189 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 LMF1Q96S06 567 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 GPHA2Q96T91 129 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CNPY3Q9BT09 278 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CALN1Q9BXU9 219 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 MIS12Q9H081 205 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 S1PR5Q9H228 398 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 EBF2Q9HAK2 575 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 NCDNQ9UBB6 729 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 STK39Q9UEW8 545 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 ITGA11Q9UKX5 1188 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 CHKBQ9Y259 395 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-212ENST00000586541 A0A0U1RQF3 1178 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 A0A1W2PPM1 405 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCDC154A6NI56 674 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 LACTBL1A8MY62 500 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 E5RJQ4 531 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 APOL1O14791 398 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 LAMTOR5O43504 91 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 PRPSAP2O60256 369 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 MGEA5O60502 916 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 ENDOD1O94919 500 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZBED1O96006 694 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 INHBAP08476 426 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 SETSIPP0DME0 302 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-212ENST00000586541 DESP17661 470 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms