RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZW10O43264 779 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FUT2Q10981 343 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf52Q5T4I8 152 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4X1Q8N118 509 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ACSL4O60488 711 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SIN3BO75182 1162 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PGK1P00558 417 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PAX3P23760 479 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN5P54829 565 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TEX44Q53QW1 395 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CNTNAP1P78357 1384 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LYPLA2O95372 231 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA1P01009 418 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FOSL2P15408 326 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OR2T3Q8NH03 318 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 NXNL1Q96CM4 212 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF224Q9NZL3 707 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PFDN2Q9UHV9 154 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQH9 124 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 AMD1P17707 334 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CCR3P51677 355 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PPM1JQ5JR12 505 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MYO19Q96H55 970 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 COPS8Q99627 209 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CIB1Q99828 191 aa21.29■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RPTORQ8N122 1335 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TLR5O60602 858 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 11e-6■□□□□ 10.1
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PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R41P59536 307 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RGS1Q08116 209 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ARF5P84085 180 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 USP41Q3LFD5 358 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 GLYATQ6IB77 296 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CARD8Q9Y2G2 431 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MAGP20916 626 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CDKN2BP42772 138 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BRCC3P46736 316 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 JAM2P57087 298 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SCAIQ8N9R8 606 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SPOCK2Q92563 424 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MST1RQ04912 1400 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 COL6A2P12110 1019 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CAPGP40121 348 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 GPR142Q7Z601 462 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SGK2Q9HBY8 427 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A7Q96T83 725 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 DCCP43146 1447 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TGFBR2P37173 567 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CPTPQ5TA50 214 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC36Q8IYA8 594 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FITM2Q8N6M3 262 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PLD5Q8N7P1 536 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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