RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574899.1

PHF23-211, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-211ENST00000574899 B4GALNT1Q00973 533 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 NRSN1Q8IZ57 195 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SPATA22Q8NHS9 363 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 TADA1Q96BN2 335 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.12■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 AGRPO00253 132 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 B4GAT1O43505 415 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ECEL1O95672 775 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 HGFP14210 728 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PYCR3Q53H96 274 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 KAZNQ674X7 775 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 NAGSQ8N159 534 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 OR2M4Q96R27 311 aa23.11■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 RCCD1A6NED2 376 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 CST8O60676 142 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PNLIPP16233 465 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PTPN3P26045 913 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ZNF75DP51815 510 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 OR1D5P58170 312 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PCSK7Q16549 785 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ARL14Q8N4G2 192 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 KRT35Q92764 455 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SLC25A51Q9H1U9 297 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 GLOD4Q9HC38 313 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 THSD1Q9NS62 852 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PRKAB1Q9Y478 270 aa23.1■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PSTPIP1O43586 416 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 DNAJC6O75061 913 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 TNFSF15O95150 251 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 EML2O95834 649 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ACTR1BP42025 376 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 INHBCP55103 352 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ACTR1AP61163 376 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 TEX44Q53QW1 395 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ZNF438Q7Z4V0 828 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 EXD1Q8NHP7 514 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 FAM83DQ9H4H8 585 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.09■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 CCKBRP32239 447 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 WASHC5Q12768 1159 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ODF2Q5BJF6 829 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 RAB11FIP2Q7L804 512 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 GPR26Q8NDV2 337 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 HAUS1Q96CS2 278 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 UBP1Q9NZI7 540 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.08■■□□□ 1.29
PHF23-211ENST00000574899 MGAQ8IWI9 3026 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 PPM1DO15297 605 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 ASMTLO95671 621 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 UGT1A5P35504 534 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 CDK18Q07002 472 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 NOMO1Q15155 1222 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 ALS2CLQ60I27 953 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 CLEC14AQ86T13 490 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 FBXO39Q8N4B4 442 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 KCNE4Q8WWG9 221 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 TEKT5Q96M29 485 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 CDH19Q9H159 772 aa23.07■■□□□ 1.28
PHF23-211ENST00000574899 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms