RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD22Q5VYY1 191 aa32.93■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAATS1Q7Z4T9 603 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIL6Q8IXY8 311 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 DTX3LQ8TDB6 740 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL26Q9NPH9 171 aa32.93■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR92Q96MX6 357 aa32.92■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 FADS2P1A8MWK0 482 aa32.92■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STPG1Q5TH74 334 aa32.92■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAT8LQ8N9F0 302 aa32.92■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCUQ8NE86 351 aa32.92■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR13C4Q8NGS5 318 aa32.92■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf47A7E2U8 309 aa32.91■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HIC2Q96JB3 615 aa32.91■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM7SF3Q9NS93 570 aa32.91■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa32.9■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CSF2P04141 144 aa32.9■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADRA1DP25100 572 aa32.9■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR56A4Q8NGH8 313 aa32.9■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX14Q96I36 57 aa32.9■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL22Q9GZX6 179 aa32.9■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 APPL1Q9UKG1 709 aa32.9■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM202A6NGA9 273 aa32.89■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPARDQ03181 441 aa32.88■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC14A1Q13336 389 aa32.88■■■□□ 2.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MNS1Q8NEH6 495 aa32.88■■■□□ 2.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP32.87■■■□□ 2.853e-48■■■■■ 50.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP9Q7RTR0 991 aa32.87■■■□□ 2.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINB12Q96P63 405 aa32.87■■■□□ 2.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB8A8MWE9 144 aa32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BM21 787 aa32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C0S8 307 aa32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHGA12O60330 932 aa32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMA3P25788 255 aa32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS15P98073 1019 aa32.87■■■□□ 2.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG11Q2TAA5 492 aa32.87■■■□□ 2.85
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