RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA2G4CQ9UP65 541 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 WASF2Q9Y6W5 498 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAMEF1O95521 474 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 CORO7P57737 925 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPA6Q8N4T0 437 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 FITM2Q8N6M3 262 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 HCAR2Q8TDS4 363 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 BIRC8Q96P09 236 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC37BQ96QE4 947 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 HPS4Q9NQG7 708 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL36AQ9UHA7 158 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa28.97■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ESR1P03372 595 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMP1P13497 986 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 BPIP17213 487 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM151BQ6UXP7 276 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPAN33Q86UF1 283 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 YAF2Q8IY57 180 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP290O15078 2479 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPAN11A1L157 253 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 DLX3O60479 287 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS26AO75436 327 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC6A11P48066 632 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 PFKPQ01813 784 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR33Q49SQ1 333 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC66Q68CR7 880 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 SORT1Q99523 831 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASB8Q9H765 288 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL26Q9NPH9 171 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA8CPA6NN73 597 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 LEFTY1O75610 366 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJB13P59910 316 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 NFATC2Q13469 925 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAPRTQ6XQN6 538 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 F8W8V4 182 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPA4LO95757 839 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD1DP15813 335 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFEBP19484 476 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNTL6Q49A17 601 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARSIQ5FYB1 569 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 DRC3Q9H069 523 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 P2RY12Q9H244 342 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRANK1O15050 2925 aa28.95■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 A8MX80 341 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD65E5RJM6 399 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1I1O60431 355 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBOX5O94941 541 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 KITP10721 976 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF30P17039 623 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.225e-9■■■■■ 27.8
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RUNX3Q13761 415 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTSL3PQ5NE16 218 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGT3A1Q6NUS8 523 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPINA9Q86WD7 417 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNJ9Q92806 393 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PBXIP1Q96AQ6 731 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 WWP1Q9H0M0 922 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 DKK3Q9UBP4 350 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 B4GALT6Q9UBX8 382 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM50BQ9Y247 325 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED16Q9Y2X0 877 aa28.94■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BPTFQ12830 3046 aa28.94■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTSQ03393 145 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPDYAQ5MJ70 313 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ISCA2Q86U28 154 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A9Q8IVM8 553 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ELSPBP1Q96BH3 223 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYADMQ96S97 322 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 S1PR5Q9H228 398 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLEC1BQ9P126 229 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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