RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 STK40Q8N2I9 435 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NAT16Q8N8M0 369 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ARMCX1Q9P291 453 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FAM50BQ9Y247 325 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PYGLP06737 847 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PBX2P40425 430 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KCNC1P48547 511 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NRIP1P48552 1158 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PLPP6Q8IY26 295 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FAM136AQ96C01 138 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FBXO10Q9UK96 956 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MATN2O00339 956 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 VPS26AO75436 327 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CALB2P22676 271 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TBCCQ15814 346 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 AGR3Q8TD06 166 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SCRN2Q96FV2 425 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GPR21Q99679 349 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 DERL2Q9GZP9 239 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 APPL1Q9UKG1 709 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 WASH3PC4AMC7 463 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TRIM24O15164 1050 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 HDAC3O15379 428 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 DIAPH2O60879 1101 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PRAMEF1O95521 474 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ESR1P03372 595 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CYP17A1P05093 508 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KRT16P08779 473 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PTPN4P29074 926 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 Q6ZVU0 165 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 P2RY12Q9H244 342 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 A0A1W2PQ67 120 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 H3BMM5 538 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GPR39O43194 453 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 BPIP17213 487 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NFKB2Q00653 900 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GEN1Q17RS7 908 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 USP45Q70EL2 814 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SNX20Q7Z614 316 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TREML1Q86YW5 311 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MAPK15Q8TD08 544 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KCNJ9Q92806 393 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 IL26Q9NPH9 171 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SMIM24O75264 130 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NIPSNAP2O75323 286 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 UGT2B4P06133 528 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TPBGLP0DKB5 382 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ADH5P11766 374 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 IMPDH1P20839 514 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PTPN5P54829 565 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ATP6V0D1P61421 351 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KCNC3Q14003 757 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 OR4D1Q15615 310 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms