RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557718.5

FOXN3-218, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 398 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-218ENST00000557718 UBXN4Q92575 508 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 DNASE1L2Q92874 299 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ART4Q93070 314 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SNF8Q96H20 258 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SMIM14Q96QK8 99 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 FCRL5Q96RD9 977 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ACOX2Q99424 681 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 VAT1Q99536 393 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SEMA3CQ99985 751 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PARD6BQ9BYG5 372 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 NOD2Q9HC29 1040 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 DONSONQ9NYP3 566 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 UBP1Q9NZI7 540 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 WHRNQ9P202 907 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PAK5Q9P286 719 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 DEC1Q9P2X7 70 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ASIC3Q9UHC3 531 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 FAM153AQ9UHL3 310 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 RSPH14Q9UHP6 348 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 NFU1Q9UMS0 254 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 DUSP12Q9UNI6 340 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 GON4LQ3T8J9 2241 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 THADAQ6YHU6 1953 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 MUC3AQ02505 3323 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PI4KAP42356 2102 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TMEM131Q92545 1883 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 UQCRHLA0A096LP55 91 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 WASH3PC4AMC7 463 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SIGLEC6O43699 453 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 USP12O75317 370 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SUN1O94901 812 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 AP2A1O95782 977 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PRLP01236 227 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CTSLP07711 333 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 UQCRHP07919 91 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 HLA-EP13747 358 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.454e-12■■□□□ 13
FOXN3-218ENST00000557718 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TPSB2P20231 275 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CD72P21854 359 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PRKCHP24723 683 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ADCY8P40145 1251 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CD86P42081 329 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 IL12RB1P42701 662 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 RENBPP51606 427 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PLTPP55058 493 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ECT2LQ008S8 904 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 MTM1Q13496 603 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TDGQ13569 410 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ZNF234Q14588 700 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ZNF235Q14590 738 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PON2Q15165 354 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PTPRRQ15256 657 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TPSAB1Q15661 275 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 DLG2Q15700 870 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PARP6Q2NL67 630 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 C2orf27AQ580R0 203 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 OR6K2Q8NGY2 324 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PTPRN2Q92932 1015 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 SERPINB12Q96P63 405 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TRIB3Q96RU7 358 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TM6SF2Q9BZW4 377 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 RAB17Q9H0T7 212 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 TMEM245Q9H330 911 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 CD248Q9HCU0 757 aa5.99□□□□□ -1.45
FOXN3-218ENST00000557718 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms