RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-215ENST00000556210 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 OR4F21O95013 312 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ZNF682O95780 498 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ALPIP09923 528 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SCNN1AP37088 669 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 AGTR2P50052 363 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CDH15P55291 814 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CEACAM7Q14002 265 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CIPCQ9C0C6 399 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 H3BSA7 217 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CLOCKO15516 846 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 FASP25445 335 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GNA12Q03113 381 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 TLR1Q15399 786 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 REP15Q6BDI9 236 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ZNF276Q8N554 614 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SEPT8Q92599 483 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 58.5
CUX1-215ENST00000556210 SIPA1L1O43166 1804 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SYCE1LA8MT33 242 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 FUT10Q6P4F1 479 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 HAPLN3Q96S86 360 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 KIFC1Q9BW19 673 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PRR23AA6NEV1 266 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GABRDO14764 452 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 OR1I1O60431 355 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ALDH1A2O94788 518 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ALBP02768 609 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 NR4A1P22736 598 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GDF5P43026 501 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 MS4A2Q01362 244 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SCD5Q86SK9 330 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 DLG3Q92796 817 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 AOC2O75106 756 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PPP3CCP48454 512 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 DIO3P55073 304 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CDKN2DP55273 166 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ATP1A4Q13733 1029 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SQLEQ14534 574 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 STEAP4Q687X5 459 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 STYXQ8WUJ0 223 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 NRBF2Q96F24 287 aa14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GJB5O95377 273 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 HSPA7P48741 367 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ACLYP53396 1101 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 NUP107P57740 925 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ADGRE1Q14246 886 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 RDH11Q8TC12 318 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 IRGQQ8WZA9 623 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 RAB26Q9ULW5 256 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 HALP42357 657 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 LZICQ8WZA0 190 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 SUSD3Q96L08 255 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 TMEM74Q96NL1 305 aa14.79□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 TTPALQ9BTX7 342 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms