RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 C9orf172C9J069 976 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 FZD6O60353 706 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PYGLP06737 847 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF30P17039 623 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ALDH4A1P30038 563 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ADCY8P40145 1251 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ARHGAP25P42331 645 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 GPR3P46089 330 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 GPR1P46091 355 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 POLD2P49005 469 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 BIRC2Q13490 618 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ODF2Q5BJF6 829 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 MANEAQ5SRI9 462 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CCNYQ8ND76 341 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 MAML1Q92585 1016 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CDH19Q9H159 772 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.39■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 SOD1P00441 154 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ITGB2P05107 769 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PDHA1P08559 390 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 MESDQ14696 234 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 LRRC66Q68CR7 880 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 DOK6Q6PKX4 331 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 DTX1Q86Y01 620 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 NAGSQ8N159 534 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PATE1Q8WXA2 126 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 FAF2Q96CS3 445 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 AP2M1Q96CW1 435 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ABCG8Q9H221 673 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CD84Q9UIB8 345 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.38■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 KDELR1P24390 212 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CD1CP29017 333 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TAS2R40P59535 323 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 XKR5Q6UX68 686 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 VASH2Q86V25 355 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 VSTM4Q8IW00 320 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 OR2M4Q96R27 311 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.37■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 A0A0J9YYE9 177 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 A0A0U1RQS6 177 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF487B1APH4 448 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TRBC1P01850 177 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CCL4P13236 92 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ACTR1BP42025 376 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ACTR1AP61163 376 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 LINC00303Q3SY05 128 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 NLRP8Q86W28 1048 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 VSIG1Q86XK7 387 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 EXD3Q8N9H8 876 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 RNF157Q96PX1 679 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 SMIM14Q96QK8 99 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 FLNCQ14315 2725 aa20.36■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 LRRD1A4D1F6 860 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PPM1DO15297 605 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 LIMK2P53671 638 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 DSC2Q02487 901 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PTSQ03393 145 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 SQSTM1Q13501 440 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 CNGA4Q8IV77 575 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 EXTL1Q92935 676 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 SCAMP4Q969E2 229 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 HDAC11Q96DB2 347 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.35■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 PTPN13Q12923 2485 aa20.34■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.34■□□□□ 0.85
NEMP1-204ENST00000554340 MFAP3LO75121 409 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms